Microsatellite markers used in amplifications of breast cancer samples
Markers highlighted in bold have been designated to comprise a diagnostic panel to evaluate colorectal cancers for MSI (45) , and underlined markers have been reported in other studies to show MSI in breast cancers. | ||||||
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Chromosome no. | Microsatellite markers | Total number of markers | Total number of reactions | |||
1 | D1S500, D1S507, D1S243, D1S305, SPTA1, D1S318, D1S117, D1S158, D1S162, D1S188, D1S228, BAT40 | 12 | 1062 | |||
2 | D2S123, BAT26 | 2 | 240 | |||
4 | BAT25 | 1 | 120 | |||
5 | D5S393, D5S404, D5S415, D5S421, D5S429, D5S656 | 6 | 360 | |||
6 | D6S252, D6S268, D6S287, D6S270, D6S292, D6S250, D6S310, D6S314, D6S311, D6S420, D6S473, D6S255, D6S442, D6S305, D6S264, D6S297 | 16 | 2613 | |||
8 | D8S133, D8S137, D8S255, D8S259, D8S261, D8S262, D8S264, D8S298, D8S503, D8S504, D8S518, D8S540, D8S549, D8S560, D8S1715, D8S1991 | 16 | 934 | |||
9 | D9S104, D9S162, D9S157, D9S156, D9S161, D9S200, D9S169, D9S171, D9S736, D9S816, D9S1747, D9S1748, D9S1749, D9S1751, D9S1752, D9S2230 | 16 | 1410 | |||
11 | D11S1324, D11S904, D11S902, D11S988, D11S29, D11S35, D11S528, INT2, D11S911, D11S917 | 10 | 1186 | |||
13 | D13S260, D13S263, D13S155, D13S284 | 4 | 460 | |||
16 | D16S541, D16S415, D16S265, D16S402, D16S413, D16S420, D16S515, D16S514, D16S511, D16S520 | 10 | 596 | |||
17 | D17S513, CHRNB1, TP53, D17S786, D17S122, THRA1, D17S579, D17S588, D17S736, D17S926, D17S250 | 11 | 1636 | |||
Total | 104 | 10617 |